HPV се свързва с около 90 % от аналните карциноми. Жени с висок риск за анален карцином са тези с високостепенни цервикални лезии, цервикални и вулварни карциноми. Мъже, имащи сексуални контакти с мъже и с хора с HIV инфекция, са също с повишен риск за анален карцином.